藥學教研室是學校重點建設的教研室之一。藥劑專業創建于2002年，是學校長期重點建設的專業，2006年被省衛生廳、教育廳評定為省級骨干專業。教研室現有專兼職教師6人，其中高級講師2人，講師4人，另有專職實驗員1人。已形成學歷、年齡層次等結構合理的師資隊伍和學術梯隊。

近年來，教研室教師在國家級及省級期刊上發表論文20余篇，擔任主編、副主編、編者編寫了《護理藥理》、《基礎醫學機能學實驗教程》、《藥劑學》等教材十余部。參與并擔任學術團體職務的機構有：全國衛生職業教育藥理學研究會、甘肅省衛生職業教育藥檢學科研究會、中國管理科學研究院學術委員會、中國紅十字會、甘肅省藥學會、甘肅省生命科學學會，中國藥理學學會等。教研室有1名教師獲國家專利1項；主持研究的課題4項，參與的科研10余項；教學優秀成果獎2例；學校優秀課件2部；獲全省衛生職業教育教學優秀獎2人次；1人獲省級“師德標兵”稱號；多名教師多次榮獲學校“園丁獎”； 2009年教藥學研室被評為學校“優秀教研室”。

藥學教研室承擔學校《藥理學》、《藥物應用護理》、《藥劑學》、《藥物化學基礎》、《藥物分析》、《藥用植物學基礎》、《天然藥物學基礎》、《天然藥物化學基礎》、《藥品市場營銷學》和《醫院藥學概要》等課程的理論和實踐教學。

藥學教研室建設有專業基礎課實驗室（生物機能實驗室）、藥學綜合教學實驗室、中藥材標本陳列室等3個實驗室。設備先進、齊全，能充分滿足藥理學、生理學、病理學等多種類型的實驗教學。